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Yo al meter sprites, hacer scripts, o meter cualquier gráfico o rutina no me sale nada de archivo BAK, es decir me sale, pero no influye en nada en el rom original, creo que es una simple copia que hace el programa.
abre el rom de nuevo y comprueba que está todo insertado.
Si ves que no, y que el archivo BAK ese tiene el tamaño de un rom de gba, cambiale la extensión y compruebalo en ese rom...
Otra cosa no puedo decirte.