Si he entendido bien, has creado un script y lo has añadido al juego y al ejecutarlo te crashea? A ver, digo yo que si lo has compilado tú, habrás utilizado XSE o algún otro programa para compilar..deberías poder abrir el script con XSE asignando este programa como editor en AdvanceMap. Igualmente ya está compilado, lo suyo sería que lo hicieras de nuevo y lo pruebes, guardando el código o simplemente no cerrando XSE. De esta manera puedes probarlo e ir editandolo. Además un script de msgbox no debería ser un problema a la hora de volver a editarlo...
Sobre el crasheo no te puedo decir apenas nada porque no has posteado el script, pero me atrevería a pensar que no está compilado correctamente y advancemap intenta ejecutar un script en una dirección vacia (FF) y crashea...
Espero haberte ayudado, Saludos!