Si no he entendido mal, lo que quieres es guardar el número de pokémon capturados en una variable para después poder hacer tus condiciones. Si tu duda es acerca de cómo hacer condiciones dependiendo de cuál sea el número, te recomiendo leer un tutorial de scripts, es algo muy básico y fácil.
Estamos en el subforo de dudas, así que supondré que tu problema es como hacer lo primero que he dicho.
Hay un special en Fire Red que se encarga de eso, concretamente el 0xD4. Este al llamarlo te guarda en la variable 0x8005 el número de pokémon avistados y en la 0x8006 los capturados.
También depende de la evaluación que quieras realizar. El special al ser llamado comprueba la variable 0x8004, si el valor de ésta es 0 hará una evaluación de la pokédex de kanto, si es cualquier otro valor que no sea 0 hará una evaluación de la pokédex nacional.
A partir de ahí sólo tienes que tirar de un compare para hacer lo que quieras
¡Nos vemos! Miau revoir~.
