http://whackahack.com/foro/203970-post103.html
No se si aún lo necesitas, pero para convertir el ASM a código máquina para la GBA necesitas un assembler. Me parece que todo el mundo (yo incluido, claro) usa GAS (GNU ASsembler), que se puede encontrar en devkitARM (devkitPro - Browse /devkitARM at SourceForge.net).
HackMew tenía un paquete por ahí con un .bat para windows, lo puedes buscar.