Hay dos opciones. La primera es que la carpeta no sea un repositorio. Para comprobarlo, activa el poder ver los elementos ocultos de las carpetas, y fíjate si en la raíz del proyecto hay una carpeta llamada ".git"). Si la hay, sí es un proyecto git, cosa que me extrañaría por el mensaje. Lo más probable es que no lo tengas, que es la otra opción. Para esto, lo único que tienes que hacer es abrir la consola desde donde compilas, como si fueras a hacer el típico make -j$(nproc), y ejecutar "git init". Después, desde GitHub Desktop, hacer click en la flechita que hay a la derecha de Current repository > Add > Add existing repository y seleccionas tu carpeta con tu proyecto.
Haces el commit pertinente y pusheas. Y ya lo deberías tener listo
Haces el commit pertinente y pusheas. Y ya lo deberías tener listo