Oye tendrías que decir cual rombase usas, bueno en mi caso yo tenia este problema con la rombase de MrDS que no es compatible con esa herramienta, intenta usando Gen3tools.
si no te funciona usar el G3T creo que deberias hablarle al creador de la ROM/Parche para que te responda si es normal que pase eso o como solucionarlo o que te pase las herramientas con las Ini necesarias
De nada y no tengas miedo a preguntar. Todos empezamos desde cero yo todavía soy un novato pero poco a poco y con el apoyo de la comunidad he ido aprendiendo.
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