Pues algo has hecho mal.
1) Abrir JPAN's Hacked Routine Applier, en él tu ROM y clickear en "Apply Character Hacks".
2) En las dos ventanas que salen poner 0x4062 y 0x4060
3) Aceptar y Save ROM.
Y luego es cuestión de escribir un script dandole X valor a la variable 0x4062 dependiendo del Back Sprite que quieras usar.
Si aun asi no funciona, es por lo que mencioné antes y que Jo7a tambien menciona en su tutorial, "la herramienta contiene una forma de cambiar el Back Sprite pero supuestamente causa problemas".