Los únicos errores que conozco del Mid2Agb es que a la hora de arrastrar el archivo MIDI al programa, éste no cree ningún archivo .s y, en el más extremo de los casos, termine eliminando el archivo MIDI.
Prueba a exportar nuevamente el archivo MIDI desde el Anvil sin utilizar ningún espacio y con el tipo 0. En una de esas y se arregla de una vez xd
PD: Es completamente inútil si lo único que haces es cambiar el nombre del archivo .s, ya que si lo haces de esa forma, los códigos que están dentro del archivo .s (Que, si mal no recuerdo, son en su mayoría el nombre del archivo MIDI) seguirían siendo el nombre con espacios de la MIDI, y, en resumidas cuentas, lo único que estarías cambiando sería el nombre del archivo y no su contenido, que es lo que importa en realidad a la hora de ensamblar la canción en Sappy.