(Nota: no hablo español, este mensaje está traducido con IA. ¡Perdón si algo suena raro!)
@xolocausto ¡Tenía exactamente el mismo problema! En DSi XL con GBARunner3 (TWiLight Menu++) el juego no guardaba: se creaba el .sav pero quedaba vacío.
La causa: GBARunner2/3 no emulan el chip flash...