te lo explicaré más detalladamente. Eso que posteaste es la paleta 0 con sus tiles, lo que quiero decir que es que quites la parte roja de la flor, con sus tres colores y la coloques en la paleta 1 o cualquier otra paleta, luego que agarres lo que quedó de la flor (el tallo, lo verde) y lo coloques sobre un tile de pasto y lo coloques así en el tileset, entonces cuando tengas que hacer el tilemap simplemente colocas el tile de la flor con el tallo abajo y las hojas de la flor que colocaste en la paleta 1, arriba, y tendrías tu flor sin problemas y te cabría la paleta y además te sobrarían 3 colores para cualquier cosa