Estoy intentando ver como ayudarte con esto, pero la verdad es que me parece un tanto extraño. Lo que he visto del bloque esta bien, el comportamiento tambien, lo unico que se me ocurre es que encuentres el tile que esta tapando al arbol, que lo tendras en el tileset y lo elimines.
AUUUUUNQUE, ese tile que se ve mal, se mueve?