Yo tengo lo solución: :D
Duda 1: Despues de hacer tus cambios en la Rom, solo guarda tus modificaciones, y despues carga el mismo archivo que usó en Advance Map, el que tiene la extención .gba o .bin, con un emulator. Yo recomendo a VisualBoyAdvance, y lo puede descargar aquí.
Duda 2: No creo...