Vamos a ver.. Que antes no tenía acceso a mi pc y no podía responder. Vamos por partes.
Lo que buscas no tiene nada que ver con el Mapping, así que el título está mal planteado.
Segundo, ¿con 'sprites grandes' te refieres a la primera imagen o la segunda?
Y tercero, no, en HGSS/DPPt no existe una herramienta independiente para editar mugshots y sprites de entrenadores como el Mugshot Editor del pack de herramientas de KazoWar, pero aún así tienes
este maravilloso tutorial que sirve para hacer justo lo que buscas en ROMs de HGSS/DPPt, simplemente usando Tinke.