a ver, empecemos por el prinicipio xD ... con un archivo .bat puedes hacer miles de cosas... pero no tiene porque ser un virus, un archivo .bat generalmente sirve como control remoto, abre las cosas que necesite el programa sin tener que abrirlos tú solo... pero para que funcione el programa supuestamente debes darle al archivo .exe... ya que es la aplicación.
la verdad, no sabía de la existencia de este programa :O pero espero haberte clareado un poco la duda para que otro la remate xD
Suerte con tu duda ;D