Eso se hace con cualquier script de nivel, no solo con script de nivel. Basta con que incluyas sl final del script estos dos comandos
hidesprite 0x(Número del mini que vas a desaparecer)
setflag 0x(Flag asignada al mini)
Siempre asegurate que en People ID de A-map el mini en cuestión tenga una flag válida asignada.