Que seas nuevo en el ROM Hacking no quita que no puedas explicar mejor qué problema o duda tienes con tu ROM.
1º No has dicho qué pack de herramientas descargaste ni para qué ROMs son, ya que no todas las herramientas funcionan para todas las versiones de Pokémon Esmeralda. Algunas sólo funcionan para la versión USA y otras se han conseguido hacer funcionales para todas las ROMs.
2º No sabes ni qué ROM base estás usando ni qué offsets tiene editados, por lo que no podemos decirte por qué VisualBoy no la reconoce ni la abre.
3º Este post no va aquí, sino en Dudas o como mucho en Pedidos si alguien quiere facilitarte lo que buscas (que no te vas a morir por buscar tú en Google), así que ya lo cambiará de sitio el correspondiente moderador del subforo cuando sea conveniente.