El inicial es algo que debes elegir tú mismo, y puede variar en función de estos factores:
1) La historia: si en tu historia hay un Pokémon que tenga una relación especial con la trama principal, ese podría ser el elegido. Si es una historia tradicional, podrías poner los típicos 3 starters.
2) Lugar donde empiezas: no tendría sentido empezar en un desierto con Pokémon de tipo agua. Es decir, que tenga un poco de lógica qué Pokémon te entregan.
3) Dificultad: en función de la dificultad que queramos darle al juego, el starter tiene que ayudarte de alguna manera u otra (o no). Por ejemplo, si al principio del juego hay muchos Pokémon de tipo hada, un acero podría ayudar si quieres que sea fácil, si quieres que tenga una dificultad intermedia, pon a alguien neutro frente a ese tipo, y si quieres que sea difícil, alguien en desventaja. Y esto no sólo se ciñe a los Pokémon que te aparecerán al principio (o en la mitad de la partida o el final), ojo, también debes tener en cuenta si el inicial podrá mega-evolucionar, si su última evolución es demasiado fuerte o no... para balancear el juego.
4) Gustos: recuerda que estás en TU proyecto, por lo que elegir un Pokémon que te guste es fundamental. Tienes que estar a gusto con tu trabajo. Si los dos Pokémon que te sugieres te gustan, pues elige en base a los otros 3 puntos.
Espero haberte ayudado. Un saludo,
Sergiofr_18, Zeon actualmente :v