Tenes un fanatismo por el gris, algo que aprendi a lo largo de hacer sprites es que siempre los colores que menos te imaginas hacen que den un buen resultado de volumen, fijate los ojos de chesnaught como los pixeles marrones le dan redondez, o los trainers de johto que corregi tienen un mejor efecto por su sombreado
Mas que nada tu principal problema es que te quedan muy planos, fijate el estilo de pokekoks, neslug, poketo, el mio e incluso de los sprites originales de gbc y te daras cuenta en como toques de pixeles de color, le dan un buen trazo a los pixeles negros, o como un poco de blanco o el color claro puede hacer mas visible el sprite.
Mas que nada a la hora de hacer trainers o sprites, hago "quimeras" de sprites para lograr al resultado final, asi tu sprite de crystal tuvo ese buen resultado (en forma, las paletas eran mejorables, pero era aceptable)