Mira, realmente que se inserte donde se inserte no tiene gran importancia. Si es el nuevo Centro Pokemon de "Ciudad Kovida" da igual, porque cuando te metes en el Centro Pokémon no te sale el cartel it poniéndote dónde estás. Sin embargo, si el jugador viera un mapa, entonces si que estaría en un lugar distinto. La solución pasa por no darle ningún mapa a este y eliminarlos de todos los lugares. Que solo pueda ver el mapa usando vuelo.
Sin embargo, creo que si quieres poner el mapa justo en en banco de Ciudad Verde, lo que tienes que hacer es, a la hora de insertar el mapa, tienes que poner los datos referentes a Ciudad Verde que te pida y NO tienes que darle a crear nuevo lugar, sino a reservar no se cuantos mapas en este banco. Cuando le das a crear nuevo lugar, simplemente "lo creas" pero no sabes dónde (generalmente en Pueblo Paleta). Por ello tienes que darle a "Reservar X espacios" y pon los que quieras. Si pones pocos tendrás que reservar más luego. Si pones muchos, habrá algunos que no utilices. Pero no importa realmente que sobren. Así que ya, como veas.