Dependiendo de la longevidad del juego, el meterlos todos puede ser bueno o no. Para juegos pequeños, una Pokédex de 200 Pokémon es más que suficiente, pero para largos, no la bajaría de 400.
400 te da suficiente margen para meter gran variedad, pero no pasa nada por meter a los 800. Eso sí...